Nel XVIII secolo, il bellissimo edificio delle Consignes Sanitaires era la sede dell’Intendance sanitaire di Marsiglia, responsabile della prevenzione delle epidemie e della quarantena sistematica delle navi.
Fu quindi in un contesto di grande vigilanza che Marsiglia costruì l’edificio delle Consignes Sanitaires nel 1719.
Nel 1720, nonostante queste misure, la nave Grand Saint-Antoine diffuse la peste in tutta la città e presto in tutta la Provenza.
Nel XIX secolo fu affiancato da un secondo padiglione (l’edificio della dogana) costruito nello stesso stile.
Oggi, l’Autorità portuale di Marsiglia Provenza Métropole desidera ristabilire la capitaneria di porto del Vieux-Port nell’ex edificio della dogana.